Biblioteker skrevet i Nextflow
rnaseq
RNA-sekventeringsanalysepipeline ved hjælp af STAR, RSEM, HISAT2 eller laks med gen-/isoformtællinger og omfattende kvalitetskontrol.
- 646
- MIT
sarek
Analysepipeline til at detektere germline eller somatiske varianter (forbehandling, variantkald og annotering) fra WGS / målrettet sekventering.
- 256
- MIT
configs
Konfigurationsfiler, der bruges til at definere parametre, der er specifikke for computermiljøer på forskellige institutioner (af nf-core).
- 71
- MIT